據臺灣《蘋果日報》報道，馬英九高票當選臺灣地區領導人，將牽動他被控涉及臺北市長特別費貪污案的審理進度，目前該案二審判他無罪，檢方上訴臺灣“最高法院”，若5月20日馬英九就職前全案仍在法院審理，“依法”就職后須停止。

　　報道說，若馬英九特別費案在5月20日前經臺灣“最高法院”駁回，馬無罪確定，應連帶會使臺灣“最高檢察署”特偵組手中其它類似的200名“首長”特別費案獲得解套。

　　臺灣“最高檢察署”表示，當初決定上訴，就是希望經臺灣“最高法院”審判結論，統一“首長”特別費的性質及相關“法律”適用。

　　反之，如臺灣“最高法院”認為二審判決適用“法律”有疑義，將全案發回臺灣“高等法院”更審，雖不代表最終結果必然對馬不利，但至少可使特偵組未來偵辦這類案件時，取得抗拒政治因素干擾的正當性，因此不論結果為何，檢方都高度期望馬英九特別費案能在5月20日前宣判。(周先）