截留挪用征地補償費16.39億
此次審計的34個項目均是高等級公路項目，會征用大量的土地。為了保證被征土地農民的利益，國家規定應給予他們相應的補償。但仍有一些地方政府及項目建設單位違規征地，截留、挪用和長期拖欠農民征地補償款，損害農民利益。
34個被審計項目中，有15個項目未經審批占用土地或違規多征土地10.29萬畝，改變土地使用性質或未按規定復墾1370多畝。貴州省遵義至崇溪河高速公路批準用地1.04萬畝，實際征地1.77萬畝。四川省廣安至南充高速公路項目至審計時尚有263畝土地未復墾。
另外，湖北、湖南、四川、云南等14省(區)共21個項目應支付給農民征地補償費51.7億元，其中16.39億元被當地政府及征地拆遷部門截留挪用、長期拖欠或扣減。如武漢繞城高速公路東北段工程征地1.03萬畝，其補償標準應為每畝1.89萬元，但實際僅按每畝4800元補償給農民，共少補償了1.45億元。
此外，四川省大竹縣至鄰水縣邱家河和廣安至南充兩個高速公路項目的征地補償款，被當地政府及其所屬部門挪用1.95億元，占補償款的46%，主要用于市政工程、開發區建設和政府部門經費支出等。
14個項目難以按期還貸
公路建設要花費大量資金，投資當然要考慮經濟回報。甚至有的高速公路建設費用幾乎全部為銀行貸款，公路建設投入使用之后經濟效益和社會效益必須做好科學準確的計算。但是，被審計的34個高等級公路項目中，仍有不少達不到預期經濟效益。
截至2005年底，此次審計竣工通車一年以上的20個項目中，有14個項目實際車流量只達到可行性研究報告預測值的60%，在規定的償債期內很難還清貸款。例如哈爾濱繞城高速公路西段項目。該路段自2004年9月通車以來，日均車流量為1761輛，僅為可行性研究報告預測值的13.8%，年收入扣除運營和維護費用后，僅夠償還一個季度的貸款利息。2004年8月竣工通車的吉林省四平至白山高等級公路，92%的建設資金是銀行貸款，按年利率5%測算，每年應付利息1.5億元；該項目2005年通行費收入6500多萬元，日均車流量、年收費收入都僅為可行性研究報告預測值的35%。
此外，甘肅省國道212線蘭州至臨洮高速公路2004年通車以來的通行費收入不到同期應支付貸款利息的40%。陜西省戶縣至勉縣高速公路已到位資金中，除車購稅等中央財政資金11.5億元外，其余30億元都是銀行貸款，省交通部門承諾用于項目建設的37.7億元資本金分文未到，預計項目建成后，將比可行性研究報告確定的還本付息額增加67.6億元。
我國高速公路建設投融資體制已經從計劃經濟體制下的投資主體單一、資金渠道惟一，發展到投資主體多元化，項目業主多層化，籌資方式多樣化。但是，現在有的地方政府只追求速度，對長期的經濟效益重視不夠。在被審計的34個高等級公路項目中，有不少項目達不到預期的經濟效益，導致難以償還貸款。
公路建設管理體制尚未理順
審計署對被審計高等級公路項目建設中存在問題的原因做了分析。
建設管理體制尚未理順是一個重要原因。目前不少公路項目的建設、籌資和還貸主要依賴政府，客觀上加快了公路建設，但也有少數地方政府過度超前建設高速公路，大大超出當地財政承受能力。再有，一些主管部門在項目建設中既是決策者，又是管理者和建設者，項目法人治理結構不完善，極易產生權錢交易、非法謀取部門和小團體利益等問題。
責任追究機制未落實到位也造成違規問題屢禁不止。一些地方政府及項目建設單位重公路項目建成數量和速度，輕項目管理和群眾利益，對歷次檢查發現的問題不及時糾正、不依法追究責任，助長擠占挪用建設資金、非法轉分包、違規征地和拖欠補償款等違法違規問題發生且屢禁不止。
此外，還有一些地方政府為了爭取立項，在可行性研究階段高估車流量，夸大預期效益，而公路建成后車流量達不到預測值，導致公路資產利用率低下；一些地方超出本地財力可能建設公路項目，建設中資本金到位率低，不得不大幅增加銀行貸款，致使建成后經營收入難以償還貸款本息。
81人被追究刑事責任
針對此次審計查出的違法違規問題，審計署還依法向司法機關、紀檢監察部門移送違法違紀案件34起，移交交通主管部門查處16起，已有81人被依法追究刑事責任或受到黨紀政紀處分。
審計署提出了審計意見，已建議交通部和有關地方政府及項目建設單位進行整改，并依法追究相關部門和個人的責任。高等級公路投資管理體制改革的速度應當加快，地方各級的交通主管部門也應轉變自身角色，加快職能轉變。
交通部已經下發文件要求各地有關交通主管部門盡快完善相關的管理制度。同時，針對招投標、建設市場監管中存在的問題，修訂了《公路工程施工招標投標管理辦法》、《公路工程施工招標資格預審辦法》、《公路建設監督管理辦法》等規范，督促各有關建設單位認真落實交通部《關于在公路建設中實行最嚴格的耕地保護制度的若干意見》，加強對征地拆遷補償費使用的監管。
交通部專門針對審計意見提出了整改措施。逐步完善行業管理體制和運營機制；加快公路投資體制改革，強化行業監管和行業自律等。(謝秋爭 金冰)
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